Tiene como objetivo fortalecer el mecanismo de gobernanza ambiental en el territorio a través de la vinculación interinstitucional, capacitación y participación ciudadana. A partir de este eje se ha logrado la firma de convenios de colaboración con instituciones gubernamentales, no gubernamentales y académicas para el fortalecimiento de las capacidades de los funcionarios públicos municipales, grupos de productores y ciudadanía en general.

Tiene como objetivo contribuir activamente en las políticas y acciones destinadas a la reducción de emisiones de gases de efecto invernadero, adaptación y mitigación al cambio climático mediante la implementación de prácticas climáticamente inteligentes en la producción agropecuaria promoviendo el manejo y aprovechamiento de los recursos naturales. El seguimiento a este eje dio origen a la estrategia “Sistemas Integrales de Producción Sustentable de Sierra Occidental y Costa” y que la JISOC sea un medio donde se canalicen recursos en favor de la producción sustentable y la conservación de los recursos naturales

Cuyo objetivo es contribuir en el manejo integral de las cuencas en el territorio mediante acciones que promuevan la conservación, aprovechamiento y restauración de los recursos naturales. En este eje se enmarcan iniciativas como Paisaje Biocultural de Sierra Occidental y Costa de Jalisco, así como la Coordinación Regional de Manejo del Fuego y Peregrino Sustentable.

Busca reforzar y desarrollar conocimientos técnicos en temas de prestación de servicios públicos municipales. Encaminado a la asesoría técnica de manera interna y externa para mejora de los servicios públicos municipales en materia de gestión integral de residuos sólidos urbanos y aguas residuales

Tiene como objetivo promover la cultura ambiental en la región a través de la educación ambiental, con el objetivo de que la ciudadanía adquiera conocimientos, valores y habilidades prácticas para participar responsable y eficazmente en la prevención y solución de los problemas ambientales. El trabajo de vinculación interinstitucional y académico ha permitido trascender el conocimiento con la ciudadanía en el cuidado del medio ambiente.